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近來(lái)有些研究自營(yíng)性氨氧化菌的分布及其歧異度時(shí),是在PCR增幅出自營(yíng)性氨氧化菌的16SrDNA之后,再利用具專(zhuān)一性探針或者DGGE的方法去探討,其目的便是要省去選殖及定序所需花費(fèi)的時(shí)間,不過(guò)由于其資料庫(kù)尚未齊全,通常還是需要演化樹(shù)圖來(lái)加以佐證,確立相對(duì)的演化位置及在環(huán)境中所扮演的角色。
在本篇研究中便是採(cǎi)用DGGE的方法來(lái)探討,而由其結(jié)果來(lái)看,在DGGE變性電泳膠上面,將不同位置所產(chǎn)生的DNA條帶從電泳膠上切下,并將DNA從膠體中純化出來(lái)再去進(jìn)行定序及序列比對(duì),結(jié)果發(fā)現(xiàn)在電泳膠上所產(chǎn)生出不同的DNA條帶,其序列亦不相同及表示不同的條帶便代表不同的菌種。但是利用這種方式來(lái)探討菌種的歧異度時(shí),菌種親緣演化關(guān)系較相近的菌種是不容易用此方法觀察出來(lái)的。
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